Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwnkQ8CIW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TwnkQ8CIW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms