Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SbsnQ8CIT9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbsnQ8CIT9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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