Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGD2

Crispld1, Cysteine-rich secretory protein LCCL domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crispld1Q8CGD2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Crispld1Q8CGD2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crispld1Q8CGD2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crispld1Q8CGD2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms