Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn5Q8CBA2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn5Q8CBA2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn5Q8CBA2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn5Q8CBA2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms