Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc186Q8C9S4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc186Q8C9S4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc186Q8C9S4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms