Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9b1Q8C0X2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9b1Q8C0X2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9b1Q8C0X2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9b1Q8C0X2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9b1Q8C0X2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc9b1Q8C0X2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9b1Q8C0X2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9b1Q8C0X2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9b1Q8C0X2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms