Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim47Q8C0E3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim47Q8C0E3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim47Q8C0E3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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