Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim35Q8C006 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms