Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arfrp1Q8BXL7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Arfrp1Q8BXL7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arfrp1Q8BXL7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arfrp1Q8BXL7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arfrp1Q8BXL7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arfrp1Q8BXL7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arfrp1Q8BXL7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Arfrp1Q8BXL7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Arfrp1Q8BXL7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms