Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcaf1Q8BNE1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcaf1Q8BNE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcaf1Q8BNE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcaf1Q8BNE1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf1Q8BNE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf1Q8BNE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf1Q8BNE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf1Q8BNE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf1Q8BNE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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