Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc2Q8BMQ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc2Q8BMQ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnc2Q8BMQ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnc2Q8BMQ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms