Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH88

Depdc1b, DEP domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc1bQ8BH88 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Depdc1bQ8BH88 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Depdc1bQ8BH88 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Depdc1bQ8BH88 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms