Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf41Q8BH75 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf41Q8BH75 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf41Q8BH75 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf41Q8BH75 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms