Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vipas39Q8BGQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vipas39Q8BGQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vipas39Q8BGQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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