Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sv2bQ8BG39 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sv2bQ8BG39 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sv2bQ8BG39 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sv2bQ8BG39 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms