Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M10.5Q85ZW7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-M10.5Q85ZW7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M10.5Q85ZW7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms