Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Liat1Q810M6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Liat1Q810M6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Liat1Q810M6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Liat1Q810M6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms