Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan18Q80WR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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Tspan18Q80WR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Tspan18Q80WR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Tspan18Q80WR1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Tspan18Q80WR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan18Q80WR1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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Tspan18Q80WR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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Tspan18Q80WR1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan18Q80WR1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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Tspan18Q80WR1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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Tspan18Q80WR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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Tspan18Q80WR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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Tspan18Q80WR1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan18Q80WR1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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Tspan18Q80WR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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Tspan18Q80WR1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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Tspan18Q80WR1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan18Q80WR1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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Tspan18Q80WR1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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