Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc1Q80VQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc1Q80VQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc1Q80VQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms