Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab3gap1Q80UJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab3gap1Q80UJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rab3gap1Q80UJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rab3gap1Q80UJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rab3gap1Q80UJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab3gap1Q80UJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab3gap1Q80UJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab3gap1Q80UJ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab3gap1Q80UJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms