Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3cQ80U95 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube3cQ80U95 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube3cQ80U95 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms