Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LnpkQ7TQ95 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LnpkQ7TQ95 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms