Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn5Q6VZZ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Opn5Q6VZZ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms