Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt9Q6RHW0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt9Q6RHW0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt9Q6RHW0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt9Q6RHW0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt9Q6RHW0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt9Q6RHW0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt9Q6RHW0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms