Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a2Q6PIE5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a2Q6PIE5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a2Q6PIE5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a2Q6PIE5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms