Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc36Q6PDM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc36Q6PDM4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc36Q6PDM4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms