Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tsen2Q6P7W5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tsen2Q6P7W5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tsen2Q6P7W5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tsen2Q6P7W5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms