Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gga2Q6P5E6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms