Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam222bQ6P539 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam222bQ6P539 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam222bQ6P539 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms