Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rprd2Q6NXI6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rprd2Q6NXI6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rprd2Q6NXI6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rprd2Q6NXI6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rprd2Q6NXI6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms