Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm4Q6IRU2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm4Q6IRU2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm4Q6IRU2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms