Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Best3Q6H1V1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Best3Q6H1V1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Best3Q6H1V1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Best3Q6H1V1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best3Q6H1V1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms