Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nop58Q6DFW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nop58Q6DFW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nop58Q6DFW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms