Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ino80dQ66JY2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ino80dQ66JY2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms