Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp9Q64HY3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp9Q64HY3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Sp9Q64HY3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Sp9Q64HY3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Sp9Q64HY3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp9Q64HY3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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Sp9Q64HY3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp9Q64HY3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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