Protein–RNA interactions for Protein: Q64338

Pde1c, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1cQ64338 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde1cQ64338 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde1cQ64338 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde1cQ64338 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms