Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
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