Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc18Q640L5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc18Q640L5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ccdc18Q640L5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc18Q640L5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc18Q640L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccdc18Q640L5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms