Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps72Q62481 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps72Q62481 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms