Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl12Q62401 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl12Q62401 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl12Q62401 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1666.3 ms