Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six1Q62231 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six1Q62231 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six1Q62231 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Six1Q62231 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six1Q62231 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six1Q62231 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six1Q62231 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Six1Q62231 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms