Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3bQ62177 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3bQ62177 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema3bQ62177 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema3bQ62177 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3bQ62177 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms