Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sin3bQ62141 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3bQ62141 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147 ms