Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctr9Q62018 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctr9Q62018 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms