Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama3Q61789 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lama3Q61789 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms