Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccne1Q61457 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccne1Q61457 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccne1Q61457 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccne1Q61457 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms