Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf235Q61116 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf235Q61116 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf235Q61116 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms