Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
JrkQ60976 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
JrkQ60976 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
JrkQ60976 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms