Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncor1Q60974 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncor1Q60974 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncor1Q60974 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncor1Q60974 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms