Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp4Q60972 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms