Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp1r1bQ60829 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r1bQ60829 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r1bQ60829 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms